Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim12Q78RX3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms