Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms