Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed3Q78IS1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms