Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc44a1Q6X893 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms