Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc4Q6S5L9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms