Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms