Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms