Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc154Q6RUT8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms