Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc82Q6PG04 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms