Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms