Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf1cQ6PDZ2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms