Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc85bQ6PDY0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc85bQ6PDY0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc85bQ6PDY0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc85bQ6PDY0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc85bQ6PDY0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc85bQ6PDY0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms