Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd4Q6PDQ2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms