Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms