Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6PD19 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6PD19 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6PD19 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6PD19 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6PD19 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6PD19 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6PD19 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6PD19 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6PD19 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6PD19 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6PD19 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6PD19 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6PD19 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6PD19 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6PD19 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6PD19 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PD19 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6PD19 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6PD19 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms