Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms