Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms