Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpbp1Q6NXH3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms