Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc66Q6NS45 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc66Q6NS45 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms