Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms