Protein–RNA interactions for Protein: Q6IME9

Krt72, Keratin, type II cytoskeletal 72, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt72Q6IME9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt72Q6IME9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms