Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms