Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms