Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn2Q68FG2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptbn2Q68FG2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms