Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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