Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms