Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna3Q65CL1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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