Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Abcg1Q64343 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Abcg1Q64343 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Abcg1Q64343 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Abcg1Q64343 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Abcg1Q64343 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms