Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
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