Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms