Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms