Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha6Q62413 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms