Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ss18Q62280 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ss18Q62280 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ss18Q62280 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ss18Q62280 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ss18Q62280 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ss18Q62280 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ss18Q62280 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ss18Q62280 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ss18Q62280 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ss18Q62280 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ss18Q62280 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ss18Q62280 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ss18Q62280 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ss18Q62280 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ss18Q62280 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ss18Q62280 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ss18Q62280 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ss18Q62280 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ss18Q62280 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ss18Q62280 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ss18Q62280 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ss18Q62280 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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