Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ttf1Q62187 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ttf1Q62187 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ttf1Q62187 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ttf1Q62187 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ttf1Q62187 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ttf1Q62187 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ttf1Q62187 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Ttf1Q62187 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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