Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Lrrn1Q61809 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Lrrn1Q61809 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Lrrn1Q61809 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Lrrn1Q61809 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Lrrn1Q61809 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Lrrn1Q61809 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Lrrn1Q61809 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Lrrn1Q61809 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Lrrn1Q61809 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Lrrn1Q61809 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Lrrn1Q61809 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Lrrn1Q61809 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Lrrn1Q61809 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Lrrn1Q61809 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Lrrn1Q61809 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Lrrn1Q61809 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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