Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms