Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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