Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnna2Q61301 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnna2Q61301 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctnna2Q61301 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna2Q61301 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms