Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms