Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamb3Q61087 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms