Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms