Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DbpQ60925 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
DbpQ60925 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms