Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms