Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms