Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms