Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms