Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms