Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SkiQ60698 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SkiQ60698 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms