Protein–RNA interactions for Protein: Q60674

Nr1d2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d2Q60674 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms