Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ClpbQ60649 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpbQ60649 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpbQ60649 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpbQ60649 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpbQ60649 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpbQ60649 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpbQ60649 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpbQ60649 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpbQ60649 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpbQ60649 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpbQ60649 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpbQ60649 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms